"כתב ההגנה הזה יצוק בעובדות, מסמכים ועדויות ששומטים כל יסוד לטענות התובע", אמר חבר הכנסת יעלון, "ועשויים להפוך את ניהול התיק הזה ל״ועדת חקירה חליפית" לפרשת השחיתות הביטחונית החמורה ביותר מאז קום המדינה. רשימת עדי ההגנה ארוכה, וחלקם טרם זכו להשמיע את קולם בפני הרשויות, עד כה. מי שמנסה להרתיע אותי מלהוסיף ולהתעקש על חקירה יסודית בפרשה באמצעות תביעת השתקה", הוסיף יעלון, "ימצא עצמו מול האמת, העובדות, ומחויבותי המוחלטת לביטחון ישראל, כמי ששירת וממשיך לשרת אותה, כחיל של המדינה, למעלה מ-50 שנה״.

תביעת לשון הרע שהגיש באוגוסט האחרון שמרון, המואשם בהלבנת הון במסגרת פרשת הצוללות, מתייחסת להתבטאויות שונות של יעלון בגנותו וקושרות אותו לפרשה. לדברי שמרון, תביעתו מתמקדת במספר פרסומים כוזבים לטענתו, בהם הואשם בקנוניה לצד גורמים נוספים, בהם ראש הממשלה נתניהו, ונציג המספנות בגרמניה, מיכאל גנור.

בכתב התביעה נגד יעלון נכתב: "במשך תקופה ארוכה פרסם הנתבע ברבים האשמות שווא, כאילו התובע פעל באופן מושחת בקשר למה שמכונה 'פרשת הצוללות' וכתוצאה ממעשיו המושחתים קיבל לידיו עשרות מיליוני אירו, שחלקם, כך לפי דברי הדיבה של הנתבע, יועדו לראש הממשלה. מדובר בפרסומים שקריים וחסרי בסיס, המהווים לשון הרע באופן מובהק". סכום התביעה עומד על כ-550 אלף שקלים.

לדברי יעלון, כלל הגורמים, לרבות שמרון, קידמו לכאורה רכש של צוללות מיותרות לצי של מדינת ישראל, בתמורה לקבלת עמלות ותשלומי שוחד בהיקף של מיליוני שקלים. בשנת 2019 פרסם סרטון בטוויטר בו איזכר את שמרון כמעורב בפרשה ואמר כי "פרשה 3000, פרשת רכש הצוללות וספינות המגן מהמספנה הגרמנית טיסנקרופ, היא פרשת השחיתות הגדולה ביותר בתולדות המדינה. כאשר כל סביבתו של ראש הממשלה נהנתה כספית ממיליוני אירו… עורך הדין הקרוב אליו (שמרון)…"

פרשת כלי השייט והצוללות (3000) היא פרשת השחיתות החמורה ביותר בתולדות המדינה.
צפו והפיצו. pic.twitter.com/NRQwLJwREj

— משה 'בּוֹגִי' יעלון (@bogie_yaalon) March 16, 2019

יעלון הגיב בזמנו לכתב התביעה ואמר: "כך מתנהגת כנופיית פשע. לא תפחידו ולא תרתיעו אותי מלהילחם על הוצאת האמת לאור".

תוך כדי דיון בכנסת להקמת וועדת חקירה לרכש כלי השייט והצוללות מ׳תיסנקרופ׳, מתפרסם שעו״ד דוד שמרון, המעורב בפרשה עד צוואר, הגיש תביעה נגדי בנושא. כך מתנהגת כנופיית פשע. לא תפחידו ולא תרתיעו אותי מלהלחם על הוצאת האמת לאור. ביטחון המדינה אינו הפקר.

— משה 'בּוֹגִי' יעלון (@bogie_yaalon) August 5, 2020

בכתב ההגנה שהגיש השבוע יעלון, באמצעות באי כוחו, הדף ודחה את הטענות המופרכות, לטענתו, שהועלו בכתב התביעה אחת לאחת. כמו כן הצהיר שבשל החשיבות הציבורית שבחשיפת פרטי פרשת השחיתות הביטחונית החמורה של רכש הצוללות וספינות המגן, וחשיפת מעורבותו של עורך הדין שמרון במסגרתה, הוא נכון לוותר על החסינות המהותית העומדת לו, בגין חלק מהפרסומים נשואי התביעה, אשר התקיימו לאחר שהושבע לכנסת.